愁云惨淡的明治时代,曾遭到新政府利用和背叛的志志雄真实(池父亲,二姐的办法已经证明无效了,我看现在只有用我想出来的那个办法了,父亲,您看行吗?您要是觉得行,我马上就去办!一分钟也不耽误,保证那个陈源会乖乖地就范,绝不至于像昨天和今天那样向他恳求还被拒绝。田政典配音)从地狱活转,而今他的阴影笼罩在和平年代的上空。似乎与此同时,绯村剑心(凉风真世配音)以及伙伴们皆明了志志雄的真正目的,即利用京都大火的混乱进军大阪。以此为契机,剑心、斋藤、相乐左之助分头向大阪挺进,而薰、弥彦、比谷清十郎以及京都御庭番众则留守戒备,随时迎接志志雄爪牙的入侵。濑田宗次郎、破军、四乃森苍紫等绝世高手相继登场,与原作大相径庭的经典对决,渐次拉开序幕……